TÜRKÇE
ENGLISH
Information
| Code | BK037 |
| Name | Molecular Methods in Entomology |
| Term | 2024-2025 Academic Year |
| Term | Fall |
| Duration (T+A) | 3-0 (T-A) (17 Week) |
| ECTS | 6 ECTS |
| National Credit | 3 National Credit |
| Teaching Language | Türkçe |
| Level | Yüksek Lisans Dersi |
| Type | Normal |
| Mode of study | Yüz Yüze Öğretim |
| Catalog Information Coordinator | Prof. Dr. KAMİL KARUT |
| Course Instructor |
Prof. Dr. KAMİL KARUT
(A Group)
(Ins. in Charge)
Mahmut Mete KARACA (A Group) (Asst. Ins.) |
Course Goal / Objective
The aim of this course is to provide information about the molecular methods used in entomology and the evaluation of the data obtained as a result of these methods.
Course Content
In this course, students will be informed about different molecular techniques used in entomology. In addition, DNA isolation from an insect will be explained and different PCR techniques used in entomology will be provided. Information about gel electrophoresis used in imaging of DNA amplified using different PCR methods will be given.
Course Precondition
No prerequest
Resources
Insect Molecular Genetics
Notes
Insect Molecular Genetics
Course Learning Outcomes
| Order | Course Learning Outcomes |
|---|---|
| LO01 | Learn isolation techniques of insect DNA |
| LO02 | Learn cloning insect DNA by Polymerase Chain Reaction (PCR) technique |
| LO03 | Learn using different PCR technique in entomology |
| LO04 | Learn gel electrophoresis technique |
| LO05 | Learn about DNA sequencing and use in entomology |
| LO06 | Learns about the phylogenetic analysis of insect DNA sequences. |
Relation with Program Learning Outcome
| Order | Type | Program Learning Outcomes | Level |
|---|---|---|---|
| PLO01 | Bilgi - Kuramsal, Olgusal | Has knowledge on basic topics about general science, general agricultural engineering and plant production | 2 |
| PLO02 | Yetkinlikler - Öğrenme Yetkinliği | Knows the biology, ecology, systematics and control strategies of diseases, pests and weeds causing yield losses in plants | 2 |
| PLO03 | Yetkinlikler - Öğrenme Yetkinliği | Knows the identification and the biology of the diseases and how to control diseases,pests and weeds causing yield losses in plants in practice | 2 |
| PLO04 | Yetkinlikler - Öğrenme Yetkinliği | Comprehends the plant protection problems, gains the ability to solve the problems via scientific methods | 3 |
| PLO05 | Beceriler - Bilişsel, Uygulamalı | Obtains the skill to use a laboratory, analyzes and evaluates the results and prepares reports | 4 |
| PLO06 | Yetkinlikler - Bağımsız Çalışabilme ve Sorumluluk Alabilme Yetkinliği | Decides to the most useful control strategy to cope with the plant protection problems and gets them to be used correctly | 1 |
| PLO07 | Yetkinlikler - Öğrenme Yetkinliği | Has necessary knowledge to use the essential technologies, synthesizes them to prepare oral presentations | 3 |
| PLO08 | Bilgi - Kuramsal, Olgusal | By synthesizing basic and conceptual knowledge about plant protection, she/he gains the ability to develop her/himself in the field of science she/he wants to specialize in, within the framework of the professional qualifications she/he has acquired during her/his undergraduate education | |
| PLO09 | Yetkinlikler - Alana Özgü Yetkinlik | He/she can follow and elucidate domestic and international periodicals in the field he/she wants to specialize in. | |
| PLO10 | Yetkinlikler - Bağımsız Çalışabilme ve Sorumluluk Alabilme Yetkinliği | Can present results of the scientific research as a report/thesis and produce scientific publications | |
| PLO11 | Yetkinlikler - Bağımsız Çalışabilme ve Sorumluluk Alabilme Yetkinliği | To be able to apply the knowledge gained on environmental/public health and biosecurity issues in relation to agricultural production. | |
| PLO12 | Yetkinlikler - Bağımsız Çalışabilme ve Sorumluluk Alabilme Yetkinliği | 116 / 5.000 Çeviri sonuçları Reaches up-to-date resources on plant protection and field and gains the ability to use them for solving problems. | |
| PLO13 | Yetkinlikler - Öğrenme Yetkinliği | Develops skills in using laboratory methods and techniques | |
| PLO14 | Yetkinlikler - Alana Özgü Yetkinlik | Can contribute to the solution of social, scientific, cultural, and ethical problems in the field of plant protection. |
Week Plan
| Week | Topic | Preparation | Methods |
|---|---|---|---|
| 1 | Introduction | Insect Molecular Genetics (Hoy M) Molecular Systematics (Hillis D.M., Moritz C., Mable B.K.) Moleküler biyolojide kullanılan yöntemler (Temizkan G., Arda N.) Moleküler biyoloji (Yıldırım A., Bardakçı F., Karataş M. ve Tanyolaç B.) | Öğretim Yöntemleri: Anlatım, Soru-Cevap, Tartışma |
| 2 | Application of molecular techniques in entomology | Insect Molecular Genetics (Hoy M) Molecular Systematics (Hillis D.M., Moritz C., Mable B.K.) Moleküler biyolojide kullanılan yöntemler (Temizkan G., Arda N.) Moleküler biyoloji (Yıldırım A., Bardakçı F., Karataş M. ve Tanyolaç B.) | Öğretim Yöntemleri: Anlatım, Soru-Cevap, Tartışma |
| 3 | DNA isolation techniques from insect-1 | Insect Molecular Genetics (Hoy M) Molecular Systematics (Hillis D.M., Moritz C., Mable B.K.) Moleküler biyolojide kullanılan yöntemler (Temizkan G., Arda N.) Moleküler biyoloji (Yıldırım A., Bardakçı F., Karataş M. ve Tanyolaç B.) | Öğretim Yöntemleri: Anlatım, Soru-Cevap, Tartışma |
| 4 | DNA isolation techniques from insect-2 | Insect Molecular Genetics (Hoy M) Molecular Systematics (Hillis D.M., Moritz C., Mable B.K.) Moleküler biyolojide kullanılan yöntemler (Temizkan G., Arda N.) Moleküler biyoloji (Yıldırım A., Bardakçı F., Karataş M. ve Tanyolaç B.) | Öğretim Yöntemleri: Anlatım, Soru-Cevap, Tartışma |
| 5 | Polymerase Chain Reaction (PCR) and applications in entomology-1 | Insect Molecular Genetics (Hoy M) Molecular Systematics (Hillis D.M., Moritz C., Mable B.K.) Moleküler biyolojide kullanılan yöntemler (Temizkan G., Arda N.) Moleküler biyoloji (Yıldırım A., Bardakçı F., Karataş M. ve Tanyolaç B.) | Öğretim Yöntemleri: Anlatım, Soru-Cevap, Tartışma |
| 6 | Polymerase Chain Reaction (PCR) and applications in entomology-2 | Insect Molecular Genetics (Hoy M) Molecular Systematics (Hillis D.M., Moritz C., Mable B.K.) Moleküler biyolojide kullanılan yöntemler (Temizkan G., Arda N.) Moleküler biyoloji (Yıldırım A., Bardakçı F., Karataş M. ve Tanyolaç B.) | Öğretim Yöntemleri: Anlatım, Soru-Cevap, Tartışma |
| 7 | Different PCR techniques used in Entomology-1 | Insect Molecular Genetics (Hoy M) Molecular Systematics (Hillis D.M., Moritz C., Mable B.K.) Moleküler biyolojide kullanılan yöntemler (Temizkan G., Arda N.) Moleküler biyoloji (Yıldırım A., Bardakçı F., Karataş M. ve Tanyolaç B.) | Öğretim Yöntemleri: Anlatım, Soru-Cevap, Tartışma |
| 8 | Mid-Term Exam | Insect Molecular Genetics (Hoy M) Molecular Systematics (Hillis D.M., Moritz C., Mable B.K.) Moleküler biyolojide kullanılan yöntemler (Temizkan G., Arda N.) Moleküler biyoloji (Yıldırım A., Bardakçı F., Karataş M. ve Tanyolaç B.) | Ölçme Yöntemleri: Yazılı Sınav |
| 9 | Different PCR techniques used in Entomology-2 | Insect Molecular Genetics (Hoy M) Molecular Systematics (Hillis D.M., Moritz C., Mable B.K.) Moleküler biyolojide kullanılan yöntemler (Temizkan G., Arda N.) Moleküler biyoloji (Yıldırım A., Bardakçı F., Karataş M. ve Tanyolaç B.) | Öğretim Yöntemleri: Anlatım, Soru-Cevap, Tartışma |
| 10 | Different PCR techniques used in Entomology-3 | Insect Molecular Genetics (Hoy M) Molecular Systematics (Hillis D.M., Moritz C., Mable B.K.) Moleküler biyolojide kullanılan yöntemler (Temizkan G., Arda N.) Moleküler biyoloji (Yıldırım A., Bardakçı F., Karataş M. ve Tanyolaç B.) | Öğretim Yöntemleri: Anlatım, Soru-Cevap, Tartışma |
| 11 | Different PCR techniques used in Entomology-4 | Insect Molecular Genetics (Hoy M) Molecular Systematics (Hillis D.M., Moritz C., Mable B.K.) Moleküler biyolojide kullanılan yöntemler (Temizkan G., Arda N.) Moleküler biyoloji (Yıldırım A., Bardakçı F., Karataş M. ve Tanyolaç B.) | Öğretim Yöntemleri: Anlatım, Soru-Cevap, Tartışma |
| 12 | Gel electrophoresis-1 | Insect Molecular Genetics (Hoy M) Molecular Systematics (Hillis D.M., Moritz C., Mable B.K.) Moleküler biyolojide kullanılan yöntemler (Temizkan G., Arda N.) Moleküler biyoloji (Yıldırım A., Bardakçı F., Karataş M. ve Tanyolaç B.) | Öğretim Yöntemleri: Anlatım, Soru-Cevap, Tartışma |
| 13 | Gel electrophoresis-2 | Insect Molecular Genetics (Hoy M) Molecular Systematics (Hillis D.M., Moritz C., Mable B.K.) Moleküler biyolojide kullanılan yöntemler (Temizkan G., Arda N.) Moleküler biyoloji (Yıldırım A., Bardakçı F., Karataş M. ve Tanyolaç B.) | Öğretim Yöntemleri: Anlatım, Soru-Cevap, Tartışma |
| 14 | Sequence of insect DNA and assessment in entomology-1 | Insect Molecular Genetics (Hoy M) Molecular Systematics (Hillis D.M., Moritz C., Mable B.K.) Moleküler biyolojide kullanılan yöntemler (Temizkan G., Arda N.) Moleküler biyoloji (Yıldırım A., Bardakçı F., Karataş M. ve Tanyolaç B.) | Öğretim Yöntemleri: Anlatım, Soru-Cevap, Tartışma |
| 15 | Sequence of insect DNA and assessment in entomology-2 | Insect Molecular Genetics (Hoy M) Molecular Systematics (Hillis D.M., Moritz C., Mable B.K.) Moleküler biyolojide kullanılan yöntemler (Temizkan G., Arda N.) Moleküler biyoloji (Yıldırım A., Bardakçı F., Karataş M. ve Tanyolaç B.) | Öğretim Yöntemleri: Anlatım, Soru-Cevap, Tartışma |
| 16 | Term Exams | Ölçme Yöntemleri: Yazılı Sınav |
|
| 17 | Term Exams | Ölçme Yöntemleri: Yazılı Sınav |
Student Workload - ECTS
| Works | Number | Time (Hour) | Workload (Hour) |
|---|---|---|---|
| Course Related Works | |||
| Class Time (Exam weeks are excluded) | 14 | 3 | 42 |
| Out of Class Study (Preliminary Work, Practice) | 14 | 5 | 70 |
| Assesment Related Works | |||
| Homeworks, Projects, Others | 0 | 0 | 0 |
| Mid-term Exams (Written, Oral, etc.) | 1 | 15 | 15 |
| Final Exam | 1 | 30 | 30 |
| Total Workload (Hour) | 157 | ||
| Total Workload / 25 (h) | 6,28 | ||
| ECTS | 6 ECTS | ||