TÜRKÇE
ENGLISH
Genel Bilgi
| Birim | FEN BİLİMLERİ ENSTİTÜSÜ |
| BİYOTEKNOLOJİ (YL) (TEZLİ) | |
| Kod | BT014 |
| Ad | Polimeraz Zincir Reaksiyonu (PZR), Optimizasyonu ve Sonuçlarının Görüntülenmesi |
| Dönem | 2018-2019 Eğitim-Öğretim Yılı |
| Dönem | Güz |
| Süre (T+U) | 2-2 (T-U) (17 Hafta) |
| AKTS | 6 AKTS |
| Yerel Kredi | 3 Yerel Kredi |
| Eğitim Dil | Türkçe |
| Seviye | Belirsiz |
| Tür | Normal |
| Öğretim Şekli | Yüz Yüze Öğretim |
| Bilgi Paketi Koordinatörü | Prof. Dr. ARMAĞAN ERDEM ÜTÜK |
| Dersin Öğretim Elemanı |
Güncel dönem ders programı henüz yapılmamıştır.
|
Dersin Amacı / Hedefi
Dersin amacı mezun olan öğrencilerin Polimeraz Zincir Reaksiyonu konusunda bilgi sahibi olmalarını, testi uygulayabilmeleri ve uygulamalar sırasında karşılaşabilecekleri problemleri çözmeleri konusunda bilgi ve beceri kazanmasını sağlamaktır.
Dersin İçeriği
Bu ders moleküler tanı ve tiplendirme tekniklerinin temeli olan Polimeraz Zincir Reaksiyonu, standardizasyonu ve sonuçların değerlendirilmesi konularını kapsar.
Dersin Ön Koşulu
Kaynaklar
Notlar
Dersin Öğrenme Çıktıları
| Sıra | Dersin Öğrenme Çıktıları |
|---|---|
| ÖÇ01 | Öğrenci hücrenin moleküler yapısını öğrenir |
| ÖÇ02 | Öğrenci dokulardan DNA eldesini öğrenir |
| ÖÇ03 | Öğrenci PZR ve PZR temelli moleküler teknikler hakkında bilgi sahibi olur |
| ÖÇ04 | Öğrenci PZR uygulaması esnasında ortaya çıkan sorunları çözer ve testi optimize eder |
| ÖÇ05 | Öğrenci PZR ürünlerinin elektroforez ve görüntüleme işlemelerini yapabilir |
Program Öğrenme Çıktıları ile İlişkisi
| Sıra | Tür | Program Öğrenme Çıktıları | Duzey |
|---|---|---|---|
| PÖÇ01 | - | Lisans düzeyi yeterliliklerine dayalı olarak, aynı veya farklı bir alanda bilgilerini uzmanlık düzeyinde geliştirir, derinleştirir ve istatistik metotları kullanarak analiz eder ve yorumlar. | |
| PÖÇ02 | - | Biyoteknoloji alanında bilgilerini uzmanlık düzeyinde geliştirebilme ve derinleştirebilme yetisini kazanır | |
| PÖÇ03 | - | Alanının ilişkili olduğu disiplinler arası etkileşimi teşhis eder | |
| PÖÇ04 | - | Alanında edindiği bilgileri farklı disiplin alanlarından gelen bilgilerle bütünleştirerek yorumlar ve yeni bilgiler oluşturur | |
| PÖÇ05 | - | Alanı ile ilgili karşılaşılan sorunları araştırma yöntemlerini kullanarak çözümler. | |
| PÖÇ06 | - | Alanı ile ilgili uygulamalarda karşılaşılan ve öngörülemeyen karmaşık sorunların çözümü için yeni stratejik yaklaşımlar geliştirir ve sorumluluk alarak çözüm üretir. | |
| PÖÇ07 | - | Alanı ile ilgili karşılaşılan sorunları araştırma yöntemlerini kullanarak çözümler. | |
| PÖÇ08 | - | Alanı ile ilgili verilerin toplanması, yorumlanması, uygulanması ve duyurulması aşamalarında toplumsal, bilimsel, kültürel ve etik değerleri gözeterek denetler ve bu değerleri öğretir. |
Haftalık Akış
| Hafta | Konu | Ön Hazırlık | Yöntemler |
|---|---|---|---|
| 1 | Hücrenin yapısı | Ders notu, Slayt gösterimi | |
| 2 | DNA'nın yapısı ve replikasyonu | Ders notu, Slayt gösterimi | |
| 3 | Transkripsiyon ve Translasyon | Ders notu, Slayt gösterimi | |
| 4 | Gen, genom ve DNA regülasyonu | Ders notu, Slayt gösterimi | |
| 5 | Mutasyonlar (Genom, Gen, DNA mutasyonları) | Ders notu, Slayt gösterimi | |
| 6 | DNA ekstraksiyon yöntemleri | Ders notu, Slayt gösterimi | |
| 7 | Polimeraz Zincir Reaksiyonu (PZR)'na giriş | Ders notu, Slayt gösterimi | |
| 8 | Ara Sınav | Sözlü sınav | |
| 9 | PZR modifikasyonları (Semi-Nested PCR, Nested PCR, Multiplex-PCR, RAPD-PCR, Real Time-PCR) | Ders notu, Slayt gösterimi | |
| 10 | PZR'de optimizasyon (enzim, tampon, magnezyum klorür, potasyum klorür, dNTP mix, primerler) | Ders notu, Slayt gösterimi | |
| 11 | PZR'de optimizasyon (Sikluslardaki parametrelerin optimizasyon) | Ders notu, Slayt gösterimi | |
| 12 | Amplifikasyon ürünlerinin elektroforezinde kullanılan jellerin (agaroz, PAGE) hazırlanması | Ders notu, Slayt gösterimi | |
| 13 | Elekroforez, jellerin boyanması ve sonuçların görüntülenmesi | Ders notu, Slayt gösterimi | |
| 14 | Elektroforez, jel hazırlama ve görüntüleme aşamalarında optimizasyon | Ders notu, Slayt gösterimi | |
| 15 | PZR de meydana gelen sorunlar ve çözüm önerileri | Ders notu, Slayt gösterimi | |
| 16 | Yarıyıl Sonu Sınavları | Sözlü sınav | |
| 17 | Yarıyıl Sonu Sınavları |