BK570 Bitki Patojen Bakterilerin Tanımında Kullanılan Teknikler II

6 AKTS - 2-2 Süre (T+U)- . Yarıyıl- 3 Yerel Kredi

Genel Bilgi

Kod BK570
Ad Bitki Patojen Bakterilerin Tanımında Kullanılan Teknikler II
Yarıyıl . Yarıyıl
Süre (T+U) 2-2 (T-U) (17 Hafta)
AKTS 6 AKTS
Yerel Kredi 3 Yerel Kredi
Eğitim Dil Türkçe
Seviye Yüksek Lisans Dersi
Tür Normal
Öğretim Şekli Yüz Yüze Öğretim
Bilgi Paketi Koordinatörü Prof. Dr. YEŞİM AYSAN


Dersin Amacı

Bu dersin amacı hasta bitkilerden izole edilmiş bakterilerin hızlı yöntemlerle tanısını yapmak ve tanının serolojik ve moleküler yöntemlerle desteklenmesidir

Dersin İçeriği

Bitkilerde hastalık yapan bakterilerin hızlı tanısı, moleküler ve serolojik (ELISA, IF, Immunostrip) yöntemlerle tanın desteklenmesi

Dersin Ön Koşulu

yok

Kaynaklar

Z. Klement, K. Rudolph,D.C. Sands, 1990. Methods in Phytobacteriology. Akademial Kiodo, Budapest. 567p. Lelliott, R. A., and D. E. Stead, 1987. Methods for the Diagnosis of Bacterial Diseases of Plants. Methods in Plant Pathology Volume 2 (Series editor T. F. Preece), Published on behalf of the British Society for Plant Pathology by Blackwell Scientific Publications, Oxford, UK., 219 pages. Saygılı, H., Şahin, F. and Aysan Y., 2006. Fitobakteriyoloji. Meta Basım Matbaacılık, İzmir, 530s.

Notlar

Agrios, G.N. 2005. Plant Pathology. Elsevier Academic Press, London, England. pp: 639-647.


Dersin Öğrenme Çıktıları

Sıra Dersin Öğrenme Çıktıları
ÖÇ01 Hasta bitkiden bakteri izolasyonunda izlenecek yolları öğrenir
ÖÇ02 Geleneksel Yöntemlere Göre Bakteri Tanısı hakkında bilgi edinir
ÖÇ03 Geleneksel tanıyı destekleyici testler hakkında bilgi edinir
ÖÇ04 ELISA testi ve bitki bakteriyolojisinde kullanımı hakkında bilgi edinir
ÖÇ05 Immunofluorescent (IF) test ve bitki bakteriyolojisinde kullanımı hakkında bilgi edinir
ÖÇ06 Immunostrip test ve bitki bakteriyolojisinde kullanımı hakkında bilgi edinir
ÖÇ07 Protein ve lipopolisakkarit (LPS) analizine göre bakteri tanısı hakkında bilgi edinir
ÖÇ08 Tüm hücre yağ asit analizine göre bakteri tanısı hakkında bilgi edinir
ÖÇ09 Bakteriyofajların tanıda kullanımı hakkında bilgi edinir
ÖÇ10 Fitobakteriyolojide biolüminescent ve flow cytometrinin kullanımı hakkında bilgi edinir
ÖÇ11 Nükleik asit temelli mikrobiyal tanı yöntemleri hakkında bilgi edinir
ÖÇ12 Bakteri DNA'sının izolasyonu hakkında bilgi edinir
ÖÇ13 Polimeraz zincir reaksiyonu (PCR) ile bakteri tanısı hakkında bilgi edinir
ÖÇ14 Multi lokus sekans analiziyle (MLST) bakteri türleri arasında akrabalığın belirlenmesi hakkında bilgi edinir
ÖÇ15 Tanıda entegrasyon hakkında detaylı bilgi edinir


Program Öğrenme Çıktıları ile İlişkisi

Sıra Tür Program Öğrenme Çıktıları Duzey
PÖÇ01 Bilgi - Kuramsal, Olgusal Temel bilim, genel ziraat mühendisliği, bitkisel üretimle ilgili temel konularda bilgi sahibi olur 1
PÖÇ02 Yetkinlikler - Öğrenme Yetkinliği Kültür bitkilerinde verim kaybına neden olan hastalık, zararlı ve yabancı otların biyolojisi, ekolojisi, sistematiği ve mücadele yöntemlerini öğrenir 2
PÖÇ03 Yetkinlikler - Öğrenme Yetkinliği Kültür bitkilerinde verim kaybına neden olan hastalık, zararlı ve yabancı otların tanısı, biyolojisi ve mücadelesini uygulamalı olarak öğrenir
PÖÇ04 Yetkinlikler - Öğrenme Yetkinliği Bitki koruma problemlerini kavrar, bilimsel yöntemlerle çözümü için gerekli beceriyi kazanır 2
PÖÇ05 Beceriler - Bilişsel, Uygulamalı Laboratuvar kullanma, analiz yapma ve sonuçları değerlendirme, yorumlama ve rapor yazma becerisi kazanır 3
PÖÇ06 Yetkinlikler - Bağımsız Çalışabilme ve Sorumluluk Alabilme Yetkinliği Bitki koruma problemlerine karşı uygun mücadele yöntemlerini seçerek, pratikte doğru kullanımını sağlar 3
PÖÇ07 Yetkinlikler - Öğrenme Yetkinliği Gerekli teknolojileri kullanarak bilgiye ulaşır, bunları sentezleyerek sözlü sunumlar yapar 3
PÖÇ08 Bilgi - Kuramsal, Olgusal Bitki koruma ile ilgili temel ve kavram bilgilerini sentezleyerek lisans eğitimi süresince edindiği mesleki yeterlilikler çerçevesinde, uzmanlaşmak istediği bilim dalına yönelik kendini geliştirme becerisi kazanır
PÖÇ09 Yetkinlikler - Alana Özgü Yetkinlik Uzmanlaşmak istediği alanda yurtiçi ve yurtdışı süreli yayınları izleyebilir ve yorumlama yetisi kazanır
PÖÇ10 Yetkinlikler - Bağımsız Çalışabilme ve Sorumluluk Alabilme Yetkinliği Elde ettiği bilimsel araştırma sonuçlarını rapor/tez haline dönüştürebilir ve bunlardan bilimsel yayınlar üreterek sunabilir
PÖÇ11 Yetkinlikler - Bağımsız Çalışabilme ve Sorumluluk Alabilme Yetkinliği Çevre/halk sağlığı ve tarımsal üretim ile ilişkili olarak biyogüvenlik konularında aldığı bilgileri uygulayabilme
PÖÇ12 Yetkinlikler - Bağımsız Çalışabilme ve Sorumluluk Alabilme Yetkinliği Bitki koruma ve alanı ile ilgili güncel kaynaklara ulaşır ve sorunların çözümü için bunları kullanma yetisi kazanır
PÖÇ13 Yetkinlikler - Öğrenme Yetkinliği Laboratuvar kullanım yöntem ve tekniklerini kullanma becerilerini geliştirir
PÖÇ14 Yetkinlikler - Alana Özgü Yetkinlik Bitki koruma alanındatoplumsal, bilimsel, kültürel ve etik sorunların çözümüne katkıda bulunabilir


Haftalık Akış

Hafta Konu Ön Hazırlık Yöntemler
1 Hasta bitkiden bakteri izolasyonunda izlenecek yollar dersle ilgili bilgilerin okunması Öğretim Yöntemleri:
Anlatım
2 Geleneksel yöntemlere göre bakteri tanısı dersle ilgili bilgilerin okunması Öğretim Yöntemleri:
Anlatım
3 Geleneksel tanıyı destekleyici testler dersle ilgili bilgilerin okunması Öğretim Yöntemleri:
Anlatım
4 ELISA testi ve bitki bakteriyolojisinde kullanımı dersle ilgili bilgilerin okunması Öğretim Yöntemleri:
Anlatım
5 Immunofluorescent (IF) test ve bitki bakteriyolojisinde kullanımı dersle ilgili bilgilerin okunması Öğretim Yöntemleri:
Anlatım
6 Immunostrip test ve bitki bakteriyolojisinde kullanımı dersle ilgili bilgilerin okunması Öğretim Yöntemleri:
Anlatım
7 Protein ve lipopolisakkarit (LPS) analizine göre bakteri tanısı dersle ilgili bilgilerin okunması Öğretim Yöntemleri:
Anlatım
8 Ara Sınav Sınavın hazırlanması Ölçme Yöntemleri:
Sözlü Sınav
9 Tüm hücre yağ asit analizine göre bakteri tanısı dersle ilgili bilgilerin okunması Öğretim Yöntemleri:
Anlatım
10 Bakteriyofajların tanıda kullanımı dersle ilgili bilgilerin okunması Öğretim Yöntemleri:
Anlatım
11 Fitobakteriyolojide biolüminescent ve flow cytometrinin kullanımı dersle ilgili bilgilerin okunması Öğretim Yöntemleri:
Anlatım
12 Nükleik asit temelli mikrobiyal tanı yöntemleri dersle ilgili bilgilerin okunması Öğretim Yöntemleri:
Anlatım
13 Bakteri DNA'sının (genomic-DNA) izolasyonu dersle ilgili bilgilerin okunması Öğretim Yöntemleri:
Anlatım
14 Polimeraz zincir reaksiyonu (PCR) ile bakteri tanısı dersle ilgili bilgilerin okunması Öğretim Yöntemleri:
Anlatım
15 Multi lokus sekans analiziyle bakteri türleri arasında akrabalığın belirlenmesi (MLST) dersle ilgili bilgilerin okunması Öğretim Yöntemleri:
Anlatım
16 Yarıyıl Sonu Sınavları Sınavın hazırlanması Ölçme Yöntemleri:
Sözlü Sınav
17 Yarıyıl Sonu Sınavları Sınavın hazırlanması Ölçme Yöntemleri:
Yazılı Sınav


Öğrenci İş Yükü - AKTS

Çalışmalar Sayısı Süresi (Saat) İş Yükü (Saat)
Ders ile İlgili Çalışmalar
Ders (Sınav haftaları dahil değildir) 14 4 56
Sınıf Dışı Ders Çalışma (Ön çalışma, pekiştirme) 14 4 56
Değerlendirmeler ile İlgili Çalışmalar
Ödev, Proje, Diğer 1 2 2
Ara Sınavlar (Yazılı, Sözlü, vs.) 1 12 12
Yarıyıl/Yıl Sonu/Final Sınavı 1 28 28
Toplam İş Yükü (Saat) 154
Toplam İş Yükü / 25 (s) 6,16
AKTS 6 AKTS