BLS402 Biyoinformatik

4 AKTS - 2-0 Süre (T+U)- 8. Yarıyıl- 2 Yerel Kredi

Genel Bilgi

Kod BLS402
Ad Biyoinformatik
Dönem 2024-2025 Eğitim-Öğretim Yılı
Yarıyıl 8. Yarıyıl
Süre (T+U) 2-0 (T-U) (17 Hafta)
AKTS 4 AKTS
Yerel Kredi 2 Yerel Kredi
Eğitim Dil Türkçe
Seviye Lisans Dersi
Tür Normal
Öğretim Şekli Yüz Yüze Öğretim
Bilgi Paketi Koordinatörü Prof. Dr. SADIK DİNÇER
Dersin Öğretim Elemanı
Güncel dönem ders programı henüz yapılmamıştır.


Dersin Amacı / Hedefi

Bu dersin amacı öğrencilere moleküler genetik yöntemlerde biyoinformatik uygulamaları konusunda deneyim kazandırmaktır.

Dersin İçeriği

Bu derste temel biyoinformatik eğitimi ve uygulamaları işlenmektedir.

Dersin Ön Koşulu

yok

Kaynaklar

Uygulamalı Biyoinformatik; Paul M.Selzer, Richard J.Marhöferü Oliver Koc,

Notlar

Biyoinformatik Temelleri ve Uygulamaları; Mehmet Cengiz Baloğlu


Dersin Öğrenme Çıktıları

Sıra Dersin Öğrenme Çıktıları
ÖÇ01 Biyoinformatiğin çalışma alanını izah eder.
ÖÇ02 Biyoinformatiğin kullanım alanları hakkında fikir edinmek
ÖÇ03 Moleküler genetik yöntemleri ile biyoinformatik arasındaki ilişkiyi açıklar
ÖÇ04 Biyoinformatik yazılımları ve veri bankalarını tanımak
ÖÇ05 yeni nesil sekanslama veri analizlerinde pratik kazanır
ÖÇ06 Büyük ölçekli gen ifade analizlerinde pratik kazanır
ÖÇ07 Meta analizlerin uygulama alanlarını açıklar
ÖÇ08 Omiks analizlerinde biyoinformatiğn önemini izah eder


Program Öğrenme Çıktıları ile İlişkisi

Sıra Tür Program Öğrenme Çıktıları Duzey
PÖÇ01 Bilgi - Kuramsal, Olgusal Biyoloji alanında temel kavram ve ilkeleri açıklar. 3
PÖÇ02 Bilgi - Kuramsal, Olgusal Biyoloji alanında edindiği bilgileri diğer bilim alanlarındaki bilgilerle birleştirir. 2
PÖÇ03 Bilgi - Kuramsal, Olgusal Biyoloji alanındaki problemleri tanımlayıp çözümlerine yönelik yöntemleri uygular. 2
PÖÇ04 Bilgi - Kuramsal, Olgusal Biyoloji alanında bilimsel bilgi üretmenin yöntemini açıklar. 3
PÖÇ05 Bilgi - Kuramsal, Olgusal Biyoloji alanında bilgilere ulaşıp tasnif ederek amacına yönelik olarak kullanır. 2
PÖÇ06 Bilgi - Kuramsal, Olgusal Biyoloji alanında edindiği ileri düzeydeki kuramsal ve uygulamalı bilgileri kullanır.
PÖÇ07 Bilgi - Kuramsal, Olgusal Alanı ile ilgili konularda ilgili kişi ve kurumları bilgilendirerek düşüncelerini ve sorunlara ilişkin önerilerini yazılı, sözlü ve görsel olarak uzman veya uzman olmayan kişilere aktarır.
PÖÇ08 Bilgi - Kuramsal, Olgusal Alanı ile ilgili uygulamalarda karşılaşılan ve öngörülemeyen sorunları çözmek için bireysel ve ekip üyesi olarak sorumluluk alır.
PÖÇ09 Bilgi - Kuramsal, Olgusal Alanı ile ilgili projelerin planlanmasında ve yürütülmesinde bir ekip üyesi olarak aktif görev alır.
PÖÇ10 Beceriler - Bilişsel, Uygulamalı Öğrenme sürecinin yaşam boyu olduğunu bilip ona göre davranır.
PÖÇ11 Yetkinlikler - Bağımsız Çalışabilme ve Sorumluluk Alabilme Yetkinliği Biyolojinin temel konuları dışında özgün seçimlik derslerle farklı alanlarda bilgisini ve deneyimini artırır.
PÖÇ12 Yetkinlikler - Bağımsız Çalışabilme ve Sorumluluk Alabilme Yetkinliği Biyoloji alanındaki temel konuları anlayacak ve meslektaşlarıyla iletişim kuracak kadar İngilizce bilgisini kavrar. 1
PÖÇ13 Yetkinlikler - Bağımsız Çalışabilme ve Sorumluluk Alabilme Yetkinliği Hem meslektaşları ile hem de alan dışı kişilerle bilgi ve iletişim teknolojilerini kullanarak etik ilişkiler kurup mesleki gelişiminin yanı sıra, ilgi ve yetenekleri doğrultusunda bilimsel, sosyal, kültürel ve sanatsal alanlarda öğrenme gereksinimlerini belirleyerek kendini sürekli geliştirir. 2
PÖÇ14 Yetkinlikler - Öğrenme Yetkinliği Biyoloji alanında gelişmeleri bilimsel yöntem ve teknikleri kullanarak çok yönlü değerlendirir. 2
PÖÇ15 Yetkinlikler - Öğrenme Yetkinliği Bireysel gelişimin önemini kavrayarak gereğini uygular.


Haftalık Akış

Hafta Konu Ön Hazırlık Yöntemler
1 Biyoinformatiğe giriş Ön hazırlık gerektirmemektir Öğretim Yöntemleri:
Anlatım
2 Biyoinformatiğin temel uygulamaları Ön hazırlık gerektirmemektedir. Öğretim Yöntemleri:
Anlatım
3 Moleküler genetikte biyoinformatik kullanımı Ön hazırlık gerektirmemektedir. Öğretim Yöntemleri:
Anlatım, Soru-Cevap
4 Biyoloji alanında biyoinformatik Ön hazırlık gerektirmemektedir. Öğretim Yöntemleri:
Anlatım
5 Dizileme yöntemlerinde biyoinformatik Ön hazırlık gerektirmemektedir. Öğretim Yöntemleri:
Anlatım
6 Yeni Nesil Dizileme (YND) Ön hazırlık gerektirmemektedir. Öğretim Yöntemleri:
Anlatım, Gösterip Yaptırma
7 Yeni Nesil Dizileme (YND) Sistemlerinin Biyoloji Alanında Kullanımı Ön hazırlık gerektirmemektedir. Öğretim Yöntemleri:
Anlatım, Gösterip Yaptırma
8 Ara Sınavlar Ön hazırlık gerektirmemektedir. Ölçme Yöntemleri:
Ödev, Yazılı Sınav, Sözlü Sınav, Performans Değerlendirmesi
9 Yeni nesil dizilemenin biyoinformatik uygulamaları Ön hazırlık gerektirmemektedir. Öğretim Yöntemleri:
Alıştırma ve Uygulama, Grup Çalışması
10 YND analiz yolaklarının oluşturulması Ön hazırlık gerektirmemektedir. Öğretim Yöntemleri:
Anlatım
11 Çıktı ve verilerin kalite tayini Ön hazırlık gerektirmemektedir. Öğretim Yöntemleri:
Anlatım
12 Biyoinformatik uygulama 1 Ön hazırlık gerektirmemektedir. Öğretim Yöntemleri:
Alıştırma ve Uygulama, Gösterip Yaptırma
13 Biyoinformatik uygulama 2 Ön hazırlık gerektirmemektedir. Öğretim Yöntemleri:
Alıştırma ve Uygulama, Gösterip Yaptırma
14 Varyant analizlinde analiz araçları Ön hazırlık gerektirmemektedir. Öğretim Yöntemleri:
Anlatım, Soru-Cevap
15 Veritabanları ve biyoinformatik kılavuzları Ön hazırlık gerektirmemektedir. Öğretim Yöntemleri:
Anlatım, Soru-Cevap
16 Yarıyıl Sonu Sınavları Ön hazırlık gerektirmemektedir. Ölçme Yöntemleri:
Yazılı Sınav, Sözlü Sınav, Ödev, Performans Değerlendirmesi
17 Yarıyıl Sonu Sınavları Ön hazırlık gerektirmemektedir. Ölçme Yöntemleri:
Ödev, Yazılı Sınav, Sözlü Sınav, Performans Değerlendirmesi


Öğrenci İş Yükü - AKTS

Çalışmalar Sayısı Süresi (Saat) İş Yükü (Saat)
Ders ile İlgili Çalışmalar
Ders (Sınav haftaları dahil değildir) 14 2 28
Sınıf Dışı Ders Çalışma (Ön çalışma, pekiştirme) 14 2 28
Değerlendirmeler ile İlgili Çalışmalar
Ödev, Proje, Diğer 0 0 0
Ara Sınavlar (Yazılı, Sözlü, vs.) 1 5 5
Yarıyıl/Yıl Sonu/Final Sınavı 1 40 40
Toplam İş Yükü (Saat) 101
Toplam İş Yükü / 25 (s) 4,04
AKTS 4 AKTS

Güncelleme Zamanı: 31.05.2024 03:17