TÜRKÇE
ENGLISH
Genel Bilgi
| Kod | BLS402 |
| Ad | Biyoinformatik |
| Dönem | 2024-2025 Eğitim-Öğretim Yılı |
| Yarıyıl | 8. Yarıyıl |
| Süre (T+U) | 2-0 (T-U) (17 Hafta) |
| AKTS | 4 AKTS |
| Yerel Kredi | 2 Yerel Kredi |
| Eğitim Dil | Türkçe |
| Seviye | Lisans Dersi |
| Tür | Normal |
| Öğretim Şekli | Yüz Yüze Öğretim |
| Bilgi Paketi Koordinatörü | Prof. Dr. SADIK DİNÇER |
| Dersin Öğretim Elemanı |
Güncel dönem ders programı henüz yapılmamıştır. |
Dersin Amacı / Hedefi
Bu dersin amacı öğrencilere moleküler genetik yöntemlerde biyoinformatik uygulamaları konusunda deneyim kazandırmaktır.
Dersin İçeriği
Bu derste temel biyoinformatik eğitimi ve uygulamaları işlenmektedir.
Dersin Ön Koşulu
yok
Kaynaklar
Uygulamalı Biyoinformatik; Paul M.Selzer, Richard J.Marhöferü Oliver Koc,
Notlar
Biyoinformatik Temelleri ve Uygulamaları; Mehmet Cengiz Baloğlu
Dersin Öğrenme Çıktıları
| Sıra | Dersin Öğrenme Çıktıları |
|---|---|
| ÖÇ01 | Biyoinformatiğin çalışma alanını izah eder. |
| ÖÇ02 | Biyoinformatiğin kullanım alanları hakkında fikir edinmek |
| ÖÇ03 | Moleküler genetik yöntemleri ile biyoinformatik arasındaki ilişkiyi açıklar |
| ÖÇ04 | Biyoinformatik yazılımları ve veri bankalarını tanımak |
| ÖÇ05 | yeni nesil sekanslama veri analizlerinde pratik kazanır |
| ÖÇ06 | Büyük ölçekli gen ifade analizlerinde pratik kazanır |
| ÖÇ07 | Meta analizlerin uygulama alanlarını açıklar |
| ÖÇ08 | Omiks analizlerinde biyoinformatiğn önemini izah eder |
Program Öğrenme Çıktıları ile İlişkisi
| Sıra | Tür | Program Öğrenme Çıktıları | Duzey |
|---|---|---|---|
| PÖÇ01 | Bilgi - Kuramsal, Olgusal | Biyoloji alanında temel kavram ve ilkeleri açıklar. | 3 |
| PÖÇ02 | Bilgi - Kuramsal, Olgusal | Biyoloji alanında edindiği bilgileri diğer bilim alanlarındaki bilgilerle birleştirir. | 2 |
| PÖÇ03 | Bilgi - Kuramsal, Olgusal | Biyoloji alanındaki problemleri tanımlayıp çözümlerine yönelik yöntemleri uygular. | 2 |
| PÖÇ04 | Bilgi - Kuramsal, Olgusal | Biyoloji alanında bilimsel bilgi üretmenin yöntemini açıklar. | 3 |
| PÖÇ05 | Bilgi - Kuramsal, Olgusal | Biyoloji alanında bilgilere ulaşıp tasnif ederek amacına yönelik olarak kullanır. | 2 |
| PÖÇ06 | Bilgi - Kuramsal, Olgusal | Biyoloji alanında edindiği ileri düzeydeki kuramsal ve uygulamalı bilgileri kullanır. | |
| PÖÇ07 | Bilgi - Kuramsal, Olgusal | Alanı ile ilgili konularda ilgili kişi ve kurumları bilgilendirerek düşüncelerini ve sorunlara ilişkin önerilerini yazılı, sözlü ve görsel olarak uzman veya uzman olmayan kişilere aktarır. | |
| PÖÇ08 | Bilgi - Kuramsal, Olgusal | Alanı ile ilgili uygulamalarda karşılaşılan ve öngörülemeyen sorunları çözmek için bireysel ve ekip üyesi olarak sorumluluk alır. | |
| PÖÇ09 | Bilgi - Kuramsal, Olgusal | Alanı ile ilgili projelerin planlanmasında ve yürütülmesinde bir ekip üyesi olarak aktif görev alır. | |
| PÖÇ10 | Beceriler - Bilişsel, Uygulamalı | Öğrenme sürecinin yaşam boyu olduğunu bilip ona göre davranır. | |
| PÖÇ11 | Yetkinlikler - Bağımsız Çalışabilme ve Sorumluluk Alabilme Yetkinliği | Biyolojinin temel konuları dışında özgün seçimlik derslerle farklı alanlarda bilgisini ve deneyimini artırır. | |
| PÖÇ12 | Yetkinlikler - Bağımsız Çalışabilme ve Sorumluluk Alabilme Yetkinliği | Biyoloji alanındaki temel konuları anlayacak ve meslektaşlarıyla iletişim kuracak kadar İngilizce bilgisini kavrar. | 1 |
| PÖÇ13 | Yetkinlikler - Bağımsız Çalışabilme ve Sorumluluk Alabilme Yetkinliği | Hem meslektaşları ile hem de alan dışı kişilerle bilgi ve iletişim teknolojilerini kullanarak etik ilişkiler kurup mesleki gelişiminin yanı sıra, ilgi ve yetenekleri doğrultusunda bilimsel, sosyal, kültürel ve sanatsal alanlarda öğrenme gereksinimlerini belirleyerek kendini sürekli geliştirir. | 2 |
| PÖÇ14 | Yetkinlikler - Öğrenme Yetkinliği | Biyoloji alanında gelişmeleri bilimsel yöntem ve teknikleri kullanarak çok yönlü değerlendirir. | 2 |
| PÖÇ15 | Yetkinlikler - Öğrenme Yetkinliği | Bireysel gelişimin önemini kavrayarak gereğini uygular. |
Haftalık Akış
| Hafta | Konu | Ön Hazırlık | Yöntemler |
|---|---|---|---|
| 1 | Biyoinformatiğe giriş | Ön hazırlık gerektirmemektir | Öğretim Yöntemleri: Anlatım |
| 2 | Biyoinformatiğin temel uygulamaları | Ön hazırlık gerektirmemektedir. | Öğretim Yöntemleri: Anlatım |
| 3 | Moleküler genetikte biyoinformatik kullanımı | Ön hazırlık gerektirmemektedir. | Öğretim Yöntemleri: Anlatım, Soru-Cevap |
| 4 | Biyoloji alanında biyoinformatik | Ön hazırlık gerektirmemektedir. | Öğretim Yöntemleri: Anlatım |
| 5 | Dizileme yöntemlerinde biyoinformatik | Ön hazırlık gerektirmemektedir. | Öğretim Yöntemleri: Anlatım |
| 6 | Yeni Nesil Dizileme (YND) | Ön hazırlık gerektirmemektedir. | Öğretim Yöntemleri: Anlatım, Gösterip Yaptırma |
| 7 | Yeni Nesil Dizileme (YND) Sistemlerinin Biyoloji Alanında Kullanımı | Ön hazırlık gerektirmemektedir. | Öğretim Yöntemleri: Anlatım, Gösterip Yaptırma |
| 8 | Ara Sınavlar | Ön hazırlık gerektirmemektedir. | Ölçme Yöntemleri: Ödev, Yazılı Sınav, Sözlü Sınav, Performans Değerlendirmesi |
| 9 | Yeni nesil dizilemenin biyoinformatik uygulamaları | Ön hazırlık gerektirmemektedir. | Öğretim Yöntemleri: Alıştırma ve Uygulama, Grup Çalışması |
| 10 | YND analiz yolaklarının oluşturulması | Ön hazırlık gerektirmemektedir. | Öğretim Yöntemleri: Anlatım |
| 11 | Çıktı ve verilerin kalite tayini | Ön hazırlık gerektirmemektedir. | Öğretim Yöntemleri: Anlatım |
| 12 | Biyoinformatik uygulama 1 | Ön hazırlık gerektirmemektedir. | Öğretim Yöntemleri: Alıştırma ve Uygulama, Gösterip Yaptırma |
| 13 | Biyoinformatik uygulama 2 | Ön hazırlık gerektirmemektedir. | Öğretim Yöntemleri: Alıştırma ve Uygulama, Gösterip Yaptırma |
| 14 | Varyant analizlinde analiz araçları | Ön hazırlık gerektirmemektedir. | Öğretim Yöntemleri: Anlatım, Soru-Cevap |
| 15 | Veritabanları ve biyoinformatik kılavuzları | Ön hazırlık gerektirmemektedir. | Öğretim Yöntemleri: Anlatım, Soru-Cevap |
| 16 | Yarıyıl Sonu Sınavları | Ön hazırlık gerektirmemektedir. | Ölçme Yöntemleri: Yazılı Sınav, Sözlü Sınav, Ödev, Performans Değerlendirmesi |
| 17 | Yarıyıl Sonu Sınavları | Ön hazırlık gerektirmemektedir. | Ölçme Yöntemleri: Ödev, Yazılı Sınav, Sözlü Sınav, Performans Değerlendirmesi |
Öğrenci İş Yükü - AKTS
| Çalışmalar | Sayısı | Süresi (Saat) | İş Yükü (Saat) |
|---|---|---|---|
| Ders ile İlgili Çalışmalar | |||
| Ders (Sınav haftaları dahil değildir) | 14 | 2 | 28 |
| Sınıf Dışı Ders Çalışma (Ön çalışma, pekiştirme) | 14 | 2 | 28 |
| Değerlendirmeler ile İlgili Çalışmalar | |||
| Ödev, Proje, Diğer | 0 | 0 | 0 |
| Ara Sınavlar (Yazılı, Sözlü, vs.) | 1 | 5 | 5 |
| Yarıyıl/Yıl Sonu/Final Sınavı | 1 | 40 | 40 |
| Toplam İş Yükü (Saat) | 101 | ||
| Toplam İş Yükü / 25 (s) | 4,04 | ||
| AKTS | 4 AKTS | ||