TÜRKÇE
ENGLISH
Genel Bilgi
| Kod | BİO528 |
| Ad | Moleküler Genetik Analiz Yöntemleri |
| Dönem | 2022-2023 Eğitim-Öğretim Yılı |
| Yarıyıl | . Yarıyıl |
| Süre (T+U) | 2-4 (T-U) (17 Hafta) |
| AKTS | 6 AKTS |
| Yerel Kredi | 4 Yerel Kredi |
| Eğitim Dil | Türkçe |
| Seviye | Yüksek Lisans Dersi |
| Tür | Normal |
| Öğretim Şekli | Yüz Yüze Öğretim |
| Bilgi Paketi Koordinatörü | Prof. Dr. AYFER PAZARBAŞI |
Dersin Amacı / Hedefi
Genomik materyal eldesi, analiz yöntemleri, yorumlanması ve uygulama alanları bilgi, beceri ve tutumlarını kazandırmak.
Dersin İçeriği
Genom analiz yöntemleri, Polimeraz zincir reaksiyonu (PCR), mekanizması ve optimizasyonunu, DNA izolasyonu, PCR ürünlerinin agaroz ve poliakrilamit jel elektroforezi, Çözeltilerin ve jellerin hazırlanması ve jellerin boyanması, QF PCR yöntemi ve QF PCR sonuçlarının analizi ve yorumlanması, PCR çeşitleri ve Uygulama alanları (Mutasyon tarama, PCR RFLP, Dizi analizi, Gen klonlama), Real Time PCR yöntem ve uygulamaları, Blotlama teknikleri
Dersin Ön Koşulu
Dersin ön koşulu yoktur.
Kaynaklar
Kasap H.(Ed.), M. Kasap, O. Demirhan, D. Alptekin, Ü. Lüleyap, A. Pazarbaşı, A.Irfan Güzel. Tıbbi Biyoloji ve Genetik, Nobel Kitabevi; ISBN: 978-605-397-059-0, 421-435, Adana (2016).
Notlar
İlişkili makaleler
Dersin Öğrenme Çıktıları
| Sıra | Dersin Öğrenme Çıktıları |
|---|---|
| ÖÇ01 | Genom analiz yöntemlerini listeler. |
| ÖÇ02 | Polimeraz zincir reaksiyonu (PCR) mekanizması ve optimizasyonunu organize eder. |
| ÖÇ03 | DNA izolasyonunu uygular |
| ÖÇ04 | PCR ürünlerinin agaroz ve poliakrilamit jel elektroforezini uygular. |
| ÖÇ05 | Çözelti ve jelleri hazırlar, jelleri boyar |
| ÖÇ06 | QF PCR yöntemini uygular |
| ÖÇ07 | PCR ve QF PCR sonuçlarını analiz eder ve yorumlar |
| ÖÇ08 | PCR çeşitlerini sıralar |
| ÖÇ09 | Uygulama alanlarını (Mutasyon tarama, PCR RFLP, Dizi analizi, Gen klonlama) sıralar |
| ÖÇ10 | Real Time PCR yöntemini tanımlar |
| ÖÇ11 | Blotlama tekniklerini açıklar |
| ÖÇ12 | Dizi analizini tanımlar |
Program Öğrenme Çıktıları ile İlişkisi
| Sıra | Tür | Program Öğrenme Çıktıları | Duzey |
|---|---|---|---|
| PÖÇ01 | Bilgi - Kuramsal, Olgusal | Canlının temel yapısını oluşturan hücre ve organellerinin yapısını ve fonksiyonlarını kavramak | 1 |
| PÖÇ02 | Bilgi - Kuramsal, Olgusal | Doku ve organ sistemlerinin fonksiyonlarını tanımak | |
| PÖÇ03 | Bilgi - Kuramsal, Olgusal | Genetik materyalin yapısını incelemek | 4 |
| PÖÇ04 | Bilgi - Kuramsal, Olgusal | Genetik hastalıkları ve hastalıklara neden olan genleri tanımak | 1 |
| PÖÇ05 | Bilgi - Kuramsal, Olgusal | Genlerin yapısını bilmek | 1 |
| PÖÇ06 | Bilgi - Kuramsal, Olgusal | Kromozom ve gen mutasyonlarını tanımlamak | 1 |
| PÖÇ07 | Bilgi - Kuramsal, Olgusal | Kalıtım biçimlerini (otozomal dominant, otozomal resesif, cinsiyete bağlı dominant ve resesif kalıtım modelleri) sınıflandırmak | |
| PÖÇ08 | Bilgi - Kuramsal, Olgusal | Moleküler ve sitogenetik tetkik ve analizleri kullanmak | 1 |
| PÖÇ09 | Bilgi - Kuramsal, Olgusal | Otozomal ve cinsiyet kromozomlarının sayısal ve yapısal anomalilerinin ne anlama geldiğini açıklayabilmek | |
| PÖÇ10 | Bilgi - Kuramsal, Olgusal | Her türlü dokudan DNA izolasyonu yapmak | 3 |
| PÖÇ11 | Bilgi - Kuramsal, Olgusal | PCR hazırlamak | 3 |
| PÖÇ12 | Bilgi - Kuramsal, Olgusal | Agaroz ve poliakrilamid jel elektroforezini yapmak ve sonuçları analiz etmek | 3 |
| PÖÇ13 | Bilgi - Kuramsal, Olgusal | Elde ettiği DNA'yı spektrofotometrede ölçebilmek | 2 |
| PÖÇ14 | Bilgi - Kuramsal, Olgusal | QF-PCR tekniğini uygulamak ve sonuçları analiz etmek | 3 |
| PÖÇ15 | Bilgi - Kuramsal, Olgusal | Kan, amniyon, koryon villüs biyopsi örneklerinden hücre kültürü yapmak, kromozom preparatını elde etmek | |
| PÖÇ16 | Bilgi - Kuramsal, Olgusal | Elde edilen kromozom preparatlarından karyotip analizini incelemek, insan kromozomlarının tamamını tanımak ve analiz etmek | |
| PÖÇ17 | Beceriler - Bilişsel, Uygulamalı | Bilimsel bir makaleyi yorumlamak ve makale nasıl yazılır kavramak |
Haftalık Akış
| Hafta | Konu | Ön Hazırlık | Yöntemler |
|---|---|---|---|
| 1 | Moleküler Genetik Tanı | Literatür tarama ve okuma | Öğretim Yöntemleri: Anlatım, Soru-Cevap, Tartışma |
| 2 | DNA izolasyonu | Literatür tarama ve okuma | Öğretim Yöntemleri: Anlatım, Soru-Cevap, Tartışma |
| 3 | PCR, Mekanizma ve Tarihçe, PCR Bileşenleri | Literatür tarama ve okuma | Öğretim Yöntemleri: Anlatım, Soru-Cevap, Tartışma |
| 4 | Primer Dizaynı, PCR Reaksiyonu Hazırlanması ve Yapılması | Literatür tarama ve okuma | Öğretim Yöntemleri: Anlatım, Soru-Cevap, Tartışma |
| 5 | PCR Ürününün Agaroz Jel Elektroforezi, PCR Ürününün Poliakrilamit Jel Elektroforezi | Literatür tarama ve okuma | Öğretim Yöntemleri: Anlatım, Soru-Cevap, Tartışma |
| 6 | PCR optimizasyonu, | Literatür tarama ve okuma | Öğretim Yöntemleri: Anlatım, Soru-Cevap, Tartışma |
| 7 | PCR sonuç analizi, sorun giderme | Literatür tarama ve okuma | Öğretim Yöntemleri: Anlatım, Soru-Cevap, Tartışma |
| 8 | Ara Sınav | Sunum hazırlama | Öğretim Yöntemleri: Anlatım, Soru-Cevap, Tartışma |
| 9 | Uygulama Alanları (Mutasyon tarama, RFLP, Allel özgü oligonükleotid: ASO) | Literatür tarama ve okuma | Öğretim Yöntemleri: Anlatım, Soru-Cevap, Tartışma |
| 10 | Mutasyonların Taranması | Literatür tarama ve okuma | Öğretim Yöntemleri: Anlatım, Soru-Cevap, Tartışma |
| 11 | Gen Klonlama | Literatür tarama ve okuma | Öğretim Yöntemleri: Anlatım, Soru-Cevap, Tartışma |
| 12 | PCR, çeşitleri (Multiplex, QF-PCR, Real time, Nested) | Literatür tarama ve okuma | Öğretim Yöntemleri: Anlatım, Soru-Cevap, Tartışma |
| 13 | DNA Dizi Analizi | Literatür tarama ve okuma | Öğretim Yöntemleri: Anlatım, Soru-Cevap, Tartışma |
| 14 | Blotlama Teknikleri | Literatür tarama ve okuma | Öğretim Yöntemleri: Anlatım, Soru-Cevap, Tartışma |
| 15 | Yeni nesil dizileme | Literatür tarama ve okuma | Öğretim Yöntemleri: Anlatım, Soru-Cevap, Tartışma |
| 16 | Yarıyıl Sonu Sınavları | Çoktan seçmeli ve klasik yazılı sınav sorusu hazırlama | Ölçme Yöntemleri: Yazılı Sınav |
| 17 | Yarıyıl Sonu Sınavları | Çoktan seçmeli ve klasik yazılı sınav sorusu hazırlama | Ölçme Yöntemleri: Yazılı Sınav |
Öğrenci İş Yükü - AKTS
| Çalışmalar | Sayısı | Süresi (Saat) | İş Yükü (Saat) |
|---|---|---|---|
| Ders ile İlgili Çalışmalar | |||
| Ders (Sınav haftaları dahil değildir) | 14 | 2 | 28 |
| Sınıf Dışı Ders Çalışma (Ön çalışma, pekiştirme) | 14 | 5 | 70 |
| Değerlendirmeler ile İlgili Çalışmalar | |||
| Ödev, Proje, Diğer | 3 | 15 | 45 |
| Ara Sınavlar (Yazılı, Sözlü, vs.) | 1 | 2 | 2 |
| Yarıyıl/Yıl Sonu/Final Sınavı | 1 | 2 | 2 |
| Toplam İş Yükü (Saat) | 147 | ||
| Toplam İş Yükü / 25 (s) | 5,88 | ||
| AKTS | 6 AKTS | ||